■本報記者 張雙虎
“就像非洲大草原上角馬過河時會(hui) 受到鱷魚攻擊一樣,生命體(ti) 遺傳(chuan) 物質——DNA核苷酸長鏈經常受到各種物理、化學或生物性(核酸酶、DNA複製叉垮塌等)因子攻擊,導致DNA斷裂。”北京大學生命科學學院教授孔道春對《中國科學報》說,“DNA同源重組是生命體(ti) 的必須過程,是修複DNA斷裂的主要途徑。細胞的DNA同源重組功能缺陷會(hui) 導致基因缺失,使人類麵臨(lin) 各類疾病。”
日前,《細胞》在線發表了孔道春課題組研究成果,他們(men) 發現了一個(ge) DNA同源重組過程必需的中間體(ti) ——RNA-DNA hybrid,及一個(ge) 必需因子——RNA聚合酶III。該研究揭示了DNA同源重組的關(guan) 鍵機製,進一步的研究將“有望極大推進癌症治療等問題的解決(jue) 。”
未解謎題
DNA同源重組是一個(ge) 基本生物事件,它在細胞生長、減數分裂、配子形成等多方麵起著重要作用。
“如果沒有這一過程,或是重組過程中出現問題,就不會(hui) 形成精子、卵子、花粉、配子等,高等生命體(ti) 的傳(chuan) 承會(hui) 出現極大問題。” 孔道春說,“同源重組也是DNA雙鏈斷裂修複的兩(liang) 大途徑之一。如果斷鏈不能修複,細胞可能會(hui) 死掉,即使它在某些條件下能重新接起來,也會(hui) 導致基因改變、缺失、不穩定,從(cong) 而引發各類疾病。”
“DNA雙鏈斷裂是引發癌症的一個(ge) 重要原因。” 該論文共同第一作者劉思傑告訴《中國科學報》,“30年前人們(men) 就發現,如果兩(liang) 個(ge) 基因(BRCA1、BRCA2)出現問題,80%的女性40歲後,會(hui) 患乳腺癌、卵巢癌。”
DNA同源重組由三大步驟組成:一是相關(guan) 核酸酶對DNA雙鏈斷裂處進行5’—鏈降解,切除數千個(ge) 核苷酸,導致3’—單鏈DNA形成。二是3’—單鏈DNA入侵同源DNA模板鏈,並作為(wei) 引物進行DNA合成及鏈交換反應,導致Holliday Junction (HJ)結構形成。三是相關(guan) 核酸酶解開HJ結構,並最終完成DNA同源重組過程。
在DNA同源重組領域,有個(ge) 關(guan) 鍵問題一直“搞不定”,即細胞是如何切除末端5’—鏈的幾千個(ge) 核苷酸,同時又保證3’—單鏈絕對完整的。
“過去幾十年,一個(ge) 被普遍接受的觀點是:3’—單鏈是通過RPA蛋白的結合得到保護的。”孔道春說,“但此觀點缺乏確切的實驗證據。”
發現“中間體(ti) ”
孔道春認為(wei) ,用蛋白結合的方式來保護幾千個(ge) 核苷酸長度的單鏈DNA不受核酸酶攻擊,“從(cong) 理論上說可能性非常小”。
“蛋白與(yu) 3’—單鏈的結合無法早於(yu) 核酸酶攻擊,幾千個(ge) 核苷酸長度上,核苷酸難以被蛋白完全覆蓋而不留任何被攻擊的空隙。客觀上,蛋白結合到DNA上並不恒定,存在‘結合—脫離—再結合’的可能。一旦蛋白脫離DNA, 核酸酶就有機會(hui) 攻擊DNA。”孔道春說,因此,細胞必定有其他機製保護DNA斷裂處的3’—單鏈DNA。
“我們(men) 發現3’—單鏈DNA是通過形成暫時的RNA-DNA雜交鏈得到保護的,RNA聚合酶III催化了RNA鏈的合成。如果阻止此處RNA合成,則DNA同源重組終止,並造成基因缺失。”劉思傑說。
該課題組發現,RNA聚合酶III是同源重組的一個(ge) 必需因子,RNA-DNA雜交鏈是DNA同源重組事件的一個(ge) 必需中間體(ti) 。
“這個(ge) 中間體(ti) 一旦被發現,一係列問題將迎刃而解。”孔道春解釋說,RNA-DNA雜交鏈中間體(ti) 的發現,能推進真核細胞DNA同源重組領域的發展,將人們(men) 對DNA同源重組事件分子機製的理解推到一個(ge) 新層次。
揭示關(guan) 鍵機製
人類一直在與(yu) 各類疾病鬥爭(zheng) ,目前全球有上千個(ge) 實驗室在進行DNA重組與(yu) 雙鏈DNA斷裂修複方麵的研究。但遺憾的是,“純機製”方麵的研究是塊“硬骨頭”,人們(men) 對其認識不足,在一些重大疾病和某些先天缺陷疾病治療方麵,手段依然有限。
“一旦搞清DNA同源重組的機製,就可以知道很多疾病到底是怎麽(me) 產(chan) 生的,也能對疾病治療和藥物開發起到重要推動作用。”孔道春說,科學家在BRCA1/2基因研究中發現,將一種酶(PARP)抑製掉後,乳腺癌、卵巢癌細胞很容易被殺死,利用該機理研製的新藥已經上市。
“我們(men) 做基礎研究,就是想把DNA同源重組、修複雙鏈斷裂的機製搞清楚。一旦機製清楚了,人們(men) 就可以找到很多疾病治療的靶點,並針對靶點研發特效藥。”孔道春說,“研究表明,大約50%~96%的各類癌症由P53蛋白缺失或功能缺陷引起,如果把P53的作用機製弄清,會(hui) 將癌症治療提高一個(ge) 層次,使癌症可以被治愈或成為(wei) 一種慢性病,從(cong) 根本上解決(jue) 癌症治療等方麵的問題。”
孔道春表示,該研究將促進相關(guan) 技術開發,包括疾病的基因治療、物種開發、抗癌藥物研發等,下一步團隊將開展藥物篩選研究。
相關(guan) 論文信息:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.048
《中國科學報》 (2021-03-19 第4版 綜合)