高精度亞洲豬參考基因組圖譜繪成
來源:科技日報
發布時間:2021-05-12
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  據中國農(nong) 業(ye) 科學院最新消息,該院北京畜牧獸(shou) 醫研究所動物基因工程與(yu) 種質創新團隊聯合北京相關(guan) 生物企業(ye) 等,成功繪製了梅山豬高質量基因組圖譜。這是迄今為(wei) 止精度最高的亞(ya) 洲豬基因組圖譜,為(wei) 我國地方豬種質資源保護和開發利用奠定了基礎。相關(guan) 成果發表於(yu) 《分子生態資源》雜誌。

  項目負責人、中國農(nong) 科院北京牧醫所周榮博士介紹,我國地方豬種具有肉質好、抗逆性強、耐粗飼等特點,是生豬種業(ye) 持續創新和實現種源自主可控的良好素材。國內(nei) 外學者針對我國地方豬種的抗病力、繁殖性能等重要經濟性狀的遺傳(chuan) 機製開展了大量研究,產(chan) 生了海量重測序、轉錄組數據。分析研究這些數據需要與(yu) 參考基因組進行比對,但目前豬功能基因組學研究大多利用西方豬種杜洛克的基因組序列,這在一定程度上限製了對亞(ya) 洲家豬的基因組學研究。

  團隊成功繪製了我國地方品種梅山豬的高質量基因組圖譜,基因組大小為(wei) 2.51Gb,共注釋到22074個(ge) 編碼基因,是目前完整度最高、連續性最強的亞(ya) 洲豬基因組圖譜。研究人員對梅山豬和杜洛克豬的基因組進行了比較分析,發現梅山豬基因組共存在49103個(ge) 結構變異,其中4.02%是亞(ya) 洲豬特有的結構變異。研究還發現亞(ya) 洲豬X染色體(ti) 上存在一個(ge) 30Mb的特有結構變異熱點,該熱點富集了與(yu) 亞(ya) 洲豬脂肪沉積、高繁殖力等特異性表型相關(guan) 的基因。

  該項研究得到國家自然科學基金重點項目、國家重點研發計劃等項目的支持。


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