上線啦!深圳國家基因庫發布『動植物資源活體庫』門戶
來源:財報網
發布時間:2021-05-28
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頭一次聽說深圳國家基因庫(簡稱“國庫”)的“活體(ti) 庫”時,不少小夥(huo) 伴自動腦補出一個(ge) 動、植物的“伊甸園”——想必生活著各種活蹦亂(luan) 跳的飛禽走獸(shou) 和生機盎然的花木果草。

其實呀,它的真麵目是這樣的:

上圖:深圳國家基因庫動植物資源活體(ti) 庫(簡稱“活體(ti) 庫”)局部

看這森嚴(yan) 的氣象、這靜穆的氛圍、這冷峻的金屬風,你是不是有很多問號?

那就要說回“活體(ti) ”這個(ge) 概念了。廣義(yi) 的“活體(ti) ”,通常指有生命的生物體(ti) 。而在國庫,“活體(ti) ”則特有所指——攜帶有遺傳(chuan) 信息、能用於(yu) 衍生出下一代的生物可繁殖體(ti) 。換句話說,就是“生命種子”。比如動物細胞、植物種子、微生物菌株,都屬於(yu) 活體(ti) 範疇。

為(wei) 什麽(me) 要保藏生物活體(ti) ?

與(yu) 其他生物樣本相比,活體(ti) 樣本不僅(jin) 攜帶有物種完整的遺傳(chuan) 物質(DNA、RNA),而且由於(yu) 具有生命活性,是許多生命科學研究的重要遺傳(chuan) 材料,能幫助我們(men) 更好地理解生物體(ti) 生長發育、衰老以及疾病發生機製等重大生命科學議題。

此外,活體(ti) 資源在減緩物種滅絕、生物育種等方麵發揮著舉(ju) 足輕重的作用。將它們(men) 保藏在適宜條件下,需要時進行複蘇培養(yang) ,可用以恢複物種種群或者改善物種性狀。

同時,活體(ti) 樣本還是多種生物醫學製品生產(chan) 的基質材料。比如,工程細胞係可用來生產(chan) 抗體(ti) 、基因重組蛋白藥物、人及獸(shou) 用疫苗等;工程菌可用來發酵,產(chan) 生重要的生物活性物質,應用於(yu) 臨(lin) 床醫學和農(nong) 業(ye) 等多個(ge) 領域。

線下→線上,活體(ti) 庫門戶營業(ye) 啦!

國庫的活體(ti) 庫,全稱是“動植物資源活體(ti) 庫”,堪稱一座“生命種子”的寶庫。它借助先進的生物技術,分離、檢測和保存活體(ti) 資源,開展資源數字化,同時對外共享活體(ti) 樣本和組學數據,支撐生物多樣性研究機構開展生命科學研究。

同時,活體(ti) 庫還建立了三大技術體(ti) 係,包括動物細胞分離、體(ti) 外培養(yang) 、細胞檢測和超低溫存儲(chu) 的技術體(ti) 係,植物物種采集、保藏和鑒定的技術體(ti) 係,微生物菌株篩選、鑒定和保藏的技術體(ti) 係,以此為(wei) 基礎,可以提供多種個(ge) 性化的技術服務。

說大事兒(er) :現在,活體(ti) 庫又多了一種打開方式——“動植物資源活體(ti) 庫”門戶在國家基因庫生命大數據平台(CNGBdb)正式上線!

上圖:深圳國家基因庫動植物資源活體(ti) 庫門戶首頁

1. 動植物、微生物,豐(feng) 富資源一覽無餘(yu)

動物:38種動物近1000份細胞係,包括永生化B淋巴細胞、成纖維細胞、間充質幹細胞和腎上皮細胞等。

植物:數百種植物的種子、憑證標本和分子材料,其中種子資源所涵蓋的物種類型豐(feng) 富多樣,包括農(nong) 作物、經濟作物、野生植物等多種具有重要科研和經濟價(jia) 值的植物物種。

微生物:2000餘(yu) 株人體(ti) 共生、豬腸道、環境來源的菌株,以及具備高GC或低GC基因組、耐高溫、質控等特點的特色菌株。其中包含1500餘(yu) 株人體(ti) 腸道細菌,涉及200個(ge) 細菌種。

2. 檢索、篩選、申請,便捷易用

動植物資源活體(ti) 庫門戶提供中、英文雙語界麵,操作便捷、直觀:

檢索樣本:在搜索框中輸入物種拉丁名、俗名或樣本編號,即可查看相關(guan) 活體(ti) 樣本的詳細信息;

篩選樣本:點擊導航欄“動物”/“植物”/“微生物”,分類別查看整體(ti) 資源情況,或縮小範圍再檢索;

技術服務:點擊導航欄“技術服務”,即可查看活體(ti) 庫對外提供的各類技術服務;

申請樣本/服務:點擊右下角“聯係我們(men) ”,填寫(xie) 您的資源使用申請或技術服務需求,國庫將盡快與(yu) 您取得聯係。

3. 資源詳情全麵展示

活體(ti) 樣本的詳情頁麵全麵展示了樣本的各類信息,以便用戶判斷該樣本能否滿足自身的需求。以小麂耳朵皮膚成纖維細胞(編號:CNGB0007)為(wei) 例,頁麵上不僅(jin) 展示了樣本的基本信息、培養(yang) 特性、檢測結果,還包含顯微照片、相關(guan) 研究成果文獻,甚至能直接訪問CNGBdb所關(guan) 聯的基因組數據。

動植物資源活體(ti) 庫線上門戶的發布,將大大提升用戶共享活體(ti) 資源、獲取平台技術服務的便利性,使國家基因庫的開放共享更進一步。

共享資源、設施,助推科研突破

自2019年以來,活體(ti) 庫為(wei) 中國科學院深圳先進技術研究院、華中科技大學、複旦大學、廣東(dong) 省農(nong) 業(ye) 科學院、山東(dong) 大學、北京協和醫院、上海仁濟醫院等20餘(yu) 家科研院所、醫療機構等提供4000餘(yu) 份活體(ti) 資源,包括動物成纖維細胞、植物種子和菌株資源,支撐多項重大科研項目開展。

同時,活體(ti) 庫還參與(yu) 了國庫與(yu) 深圳華大生命科學研究院、荷蘭(lan) 遺傳(chuan) 資源中心合作開展的生菜群體(ti) 測序項目,搜集了3000餘(yu) 份生菜種質資源,打造了全世界最齊全的生菜資源庫及遺傳(chuan) 信息庫。項目一期對來自全球47個(ge) 國家的445份生菜種質資源展開全基因組重測序工作,全麵揭示了栽培生菜的完整馴化進程。項目成果於(yu) 2021年4月12日發表於(yu) 《Nature Genetics》。

此前,活體(ti) 庫還支撐了人體(ti) 腸道細菌基因組集(Culturable Genome Reference, CGR)建立項目,采用人體(ti) 腸道高通量培養(yang) 組學技術,篩選、保藏了2萬(wan) 餘(yu) 株人體(ti) 腸道細菌菌株資源,覆蓋200餘(yu) 個(ge) 細菌種屬,並獲得了1520個(ge) 細菌基因組序列。這是目前全球最大的人體(ti) 腸道細菌基因組集,相關(guan) 成果2019年2月發表於(yu) 《Nature Biotechnology》。

活體(ti) 庫立足於(yu) 國庫強大的生物樣本及信息存儲(chu) 能力、基因組信息解讀能力以及基因組合成與(yu) 編輯的能力,致力於(yu) 建設數字化的生物多樣性基地和生物資源庫,以期促進生物物種多樣性的保護和生物遺傳(chuan) 資源的開發利用。通過分發共享高質量的生物資源、提供優(you) 質全麵的技術服務,以更好地服務於(yu) 現代科研和相關(guan) 產(chan) 業(ye) 發展。

上圖:活體(ti) 庫工作場景

國庫期待與(yu) 更多科研機構、產(chan) 業(ye) 單位通力合作,踐行國家賦予國庫的使命,以領先的設施平台和技術實力,為(wei) 行業(ye) 注入核心力量,助力提高科研效率、促進行業(ye) 繁榮、建立開放穩健的行業(ye) 生態圈。


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