英國《自然》《自然·通訊》《自然·醫學》雜誌近日同時發表來自多家研究機構的一係列報告,集中描述了對一個(ge) 匯集了逾14萬(wan) 人樣本的數據庫——基因組聚集數據庫(gnomAD)的應用,該數據庫擁有迄今最大規模的人類遺傳(chuan) 變異體(ti) 公開目錄,是我們(men) 深入認識人類基因功能、發現新疾病相關(guan) 基因的寶貴資源。
人類基因組中絕大多數基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發生突變後的結果。這些變異體(ti) 往往會(hui) 產(chan) 生不良結果,但通常較為(wei) 罕見。大規模基因測序研究有助於(yu) 考察這些功能喪(sang) 失型變異體(ti) 的效應,或能帶來對人類生物學特征和疾病的重要見解。
此次《自然》發表的一篇概述性報告中,美國麻省理工學院—哈佛大學博德研究所科學家康拉德·卡澤維斯基及其同事,描述了從(cong) 125748個(ge) 全外顯子組和15708個(ge) 全基因組測序數據集中鑒定出的443769個(ge) 預測的功能喪(sang) 失型變異體(ti) 。鑒於(yu) 這些變異體(ti) 預計會(hui) 影響其編碼蛋白的正常運作,團隊進而評估了這些變異體(ti) 對生理機能的影響:究竟是幾乎沒有影響,還是會(hui) 導致嚴(yan) 重的健康問題。《自然》同時發表的另外兩(liang) 篇報告,利用該數據庫創建了一個(ge) 結構性變異體(ti) 資源庫,並評估了基因缺失、複製,甚至是顛倒方向所產(chan) 生的影響。
同時出爐的其他報告,探討了如何利用人類功能喪(sang) 失型變異體(ti) 評價(jia) 候選藥物靶點,提升對遺傳(chuan) 變異體(ti) 的臨(lin) 床解讀,以及如何更詳細地考察特異性功能喪(sang) 失型變異體(ti) 。譬如英國帝國理工學院科學家尼古拉·威芬和同事分析了與(yu) 帕金森病風險增加相關(guan) 的一個(ge) 基因的變異體(ti) ,結果顯示靶向這個(ge) 基因或是一種安全的治療方法。
科學家們(men) 表示,gnomAD項目的樣本量是其前任的兩(liang) 倍多,之前的外顯子組聚集聯盟(ExAC)收錄了6萬(wan) 多個(ge) 外顯子組數據。卡澤維斯基與(yu) 同事也指出,他們(men) 距離鑒定出人類全部的預測功能喪(sang) 失型變異體(ti) 還很遙遠,盡管如此,他們(men) 認為(wei) 這項資源能夠提升我們(men) 對罕見和常見遺傳(chuan) 病的評估。
總編輯圈點
生物學和醫學的發展,已經使科學家對很多疾病的研究直抵分子和基因層麵。深入研究人類基因組,成為(wei) 解鎖諸多重大疾病病因的關(guan) 鍵,帕金森症、阿爾茲(zi) 海默症、自閉症等一係列病因複雜的疾病都在此列。除了尋找病因,對人類基因組的破譯,也可以為(wei) 很多疾病的治療定位重要藥物靶點,從(cong) 而為(wei) 研發更有效的生物藥物、製定更精準的診療方案帶來希望。
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