生物科普:冠狀病毒的變異程度有上限嗎?
來源:新浪科技
發布時間:2021-02-23
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冠狀病毒的變異程度有上限嗎?專家指出,它們的變異似乎是無窮無盡的……

 

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美國哥倫(lun) 比亞(ya) 大學微生物學、免疫學教授文森特__拉卡內(nei) 洛說:“病毒變異是有一定限度的,但我們(men) 並不知道為(wei) 什麽(me) 會(hui) 這樣,可能出現的基因突變數量比宇宙所有原子數量更多,很大一部分基因組都可以被替換。”(Image credit: Shutterstock)

 

  盡管世界各國的科研專(zhuan) 家都在競相研製新冠病毒接種疫苗,但是冠狀病毒仍在變異之中,也在發生基因變化。包括SARS在內(nei) ,病毒本身發生變異也都是正常現象,但病毒的變異程度以及人類致病性有一定限度嗎?或者冠狀病毒會(hui) 無限期地繼續進化嗎?

 

  美國哥倫(lun) 比亞(ya) 大學微生物學、免疫學教授文森特·拉卡內(nei) 洛說:“病毒變異是有一定限度的,但我們(men) 並不知道為(wei) 什麽(me) 會(hui) 這樣,可能出現的基因突變數量比宇宙所有原子數量更多,很大一部分基因組都可以被替換。”

 

  冠狀病毒的基因序列是由4個(ge) 不同化學基對或分子構成,達到29881個(ge) 生化字母長度,這些生化字母提供9860個(ge) 氨基酸指令,這些氨基酸是病毒蛋白質的基本組成部分,當這些化學基對發生變化時,氨基酸也相應地發生變化,從(cong) 而影響病毒蛋白質的形狀,反過來蛋白質形狀的變化也會(hui) 影響病毒功能,例如:病毒如何與(yu) 人類細胞結合在一起。

 

  拉卡內(nei) 洛說:“之前對其他RNA病毒的研究,例如:SARS病毒有一條單鏈RNA作為(wei) 它們(men) 的遺傳(chuan) 物質,發現這些病毒一半以上的基對可以被改變。”從(cong) 數學角度上講,這意味著如果某個(ge) 病毒擁有10000個(ge) 基對,就會(hui) 存在4^5000個(ge) 基因序列的可能性。

 

  考慮到可見宇宙中存在4^135個(ge) 原子,將該公式套用於(yu) 類似SARS的病毒,那麽(me) 它的基因序列可能有4^14941種組合方式,這僅(jin) 是計算基礎生化字母的變化,一種化學物質取代另一種,拉卡內(nei) 洛說:“基因組中還有其他的突變,例如:缺失或者插入,這將進一步增大基因序列可能性數量。”

 

  但是這些突變中的大多數都是無關(guan) 緊要的,而且其中很大一部分會(hui) 立即被淘汰,拉卡內(nei) 洛說:“有些突變是致命的,所以我們(men) 從(cong) 未見過,但許多突變是中立的,它們(men) 隻是不斷累積,重要的突變通常發生在冠狀病毒的刺突蛋白上,這是它用於(yu) 捕獲人類細胞表麵ACE2受體(ti) 的武器。刺突自身是由1273個(ge) 氨基酸組成,這些氨基酸由3831個(ge) 化學基對編碼,因此依據相同的數學邏輯,刺突蛋白的編碼有4^1916種變化方式,幾乎是無限的,盡管如此,這些突變中存在許多冗餘(yu) ,編碼的是相同的氨基酸。”

 

  此外,美國康奈爾大學微生物學和免疫學教授約翰·摩爾稱,並不是每個(ge) 突變都能被識別為(wei) “變異”,一些突變是悄然發生的,被識別並命名的變異通常具有顯著特性,例如:更容易傳(chuan) 染給人類,或者疫苗對其無效。

 

  強有力的監測機製可以幫助科學家通過對感染人群的隨機抽樣,掃描發現病毒基因的變化,一旦他們(men) 發現了潛在的重要突變,例如:這些突變出現在基因組的哪裏,他們(men) 就可以將這些突變插入刺突蛋白和ACE2受體(ti) 相互作用的計算機模型中,從(cong) 而預測該突變將如何表現,但為(wei) 了最終理解這種突變如何改變病毒的行為(wei) ,他們(men) 必須對病毒或者蛋白質做實驗。

 

  之前的突變

 

  第一個(ge) SARS病毒變種是2020年春季發現的,當時武漢首次檢測到原始病毒被一種叫做D614G的新變種所取代,依據摩爾參與(yu) 撰寫(xie) 的《美國醫學會(hui) 雜誌》所提及的觀點,該新變種可能出現在歐洲,摩爾說,直到2020年夏季末,科學家才發現這種病毒變異可能增強了它們(men) 的複製傳(chuan) 播能力。

 

  雖然新型冠狀病毒的變異程度不像艾滋病毒或者流感病毒那麽(me) 嚴(yan) 重,但摩爾指出,將該病毒植入1億(yi) 人體(ti) 內(nei) ,就會(hui) 發生變異。2020年8月,英國出現另一種叫做B.1.1.7的新冠病毒變種,同年11月該病毒變種擴散速度加快。早期研究表明,新冠病毒變異的主要突變N501Y,再次出現傳(chuan) 播能力增強,但應用於(yu) 新冠病毒D614G突變和其他之前的冠狀病毒菌株的抗體(ti) 對N501Y有效。

 

  另外,一種更令人擔憂的新冠病毒突變出現在南非,它叫做B.1.351或者N501Y.V2,該病毒變種與(yu) 英國境內(nei) 出現的B.1.1.7十分相似,但它在受體(ti) 與(yu) 刺突蛋白結合區域出現突變,該區域正是刺突蛋白與(yu) 人類細胞 ACE2結合的位置,新冠病毒最關(guan) 鍵的突變是E484K,它改變了受體(ti) 結合區域(RBD)的形狀,足以使識別早期抗體(ti) 很難識別的新變異菌株。

 

  之前幾項研究表明,Moderna、輝瑞、諾瓦瓦克斯和強生等公司研製的疫苗仍可以抵禦冠狀病毒變異,但效果不如針對早期病毒變異的疫苗有效。

 

  另一種與(yu) B.1.351類似的病毒變種叫做P.1,也出現在巴西境內(nei) ,由於(yu) 它與(yu) 南非新冠病毒變種存在相似性,它的出現令科學家感到擔憂。目前,科學家發現一些B.1.1.7病毒變種也出現突變,甚至E484K也出現突變。

 

  拉卡內(nei) 洛稱,受體(ti) 結合區域是一個(ge) 可能發生突變的區域,它是由223個(ge) 氨基酸組成,其中22個(ge) 氨基酸與(yu) 人類細胞上的ACE2受體(ti) 發生接觸,這些氨基酸中任何一種都可能發生變化(由於(yu) 受體(ti) 結合區域潛在著基因序列突變),並增大其與(yu) 人類細胞的接觸,從(cong) 而增強侵入能力。

 

  為(wei) 什麽(me) 病毒會(hui) 發生突變?

 

  突變有時反映了一種“建立者效應”,病毒發生變異,由於(yu) 病毒變體(ti) 碰巧進入了廣泛傳(chuan) 播病毒的人體(ti) 內(nei) ,它逐漸具有顯性優(you) 勢,但這並不一定意味著突變就存在著優(you) 勢。

 

  美國波士頓大學醫學院生物化學助理教授、國家新興(xing) 傳(chuan) 染病實驗室研究員摩桑·薩伊德說:“但有時相同或者非常相似的突變,例如:N501Y突變會(hui) 出現在世界不同地區,這通常意味著突變會(hui) 對病毒帶來一定優(you) 勢。”

 

  薩伊德稱,目前冠狀病毒已經非常易於(yu) 感染人類,所以它未來從(cong) 突變中獲得任何優(you) 勢可能都不會(hui) 太大,這相當於(yu) 你的收音機已經開到10分貝音量,如果將音量調到11分貝時,也不會(hui) 有太大差別。

 

  未來不久人類開始大範圍地注射冠狀病毒疫苗,將會(hui) 發生什麽(me) 呢?薩伊德說:“在這種情況下,疫苗可能刺激病毒產(chan) 生‘逃逸突變’,從(cong) 而實現阻止中和抗體(ti) 的能力。”

 

  未來發生的病毒突變

 

  SARS病毒在人類中傳(chuan) 播的時間很短,目前科學家還不能依據模擬或者病毒曆史來預測未來該病毒會(hui) 出現怎樣的變種,這存在很大的隨機性。

 

  摩爾說:“我們(men) 不是發號施令者,我們(men) 隻是對病毒做出反應,換句話講,病毒突變是在野生環境中發生的,科學家正在研究它們(men) 的傳(chuan) 染性、致命性,以及它們(men) 對疫苗的‘逃逸突變’影響,雖然在病毒發生突變之前領先一步是有益的,例如:基於(yu) 模擬測試,預測其他突變是否可能出現,但考慮到病毒變異的程度,這可能是不可行的。蛋白質與(yu) 受體(ti) 或者抗體(ti) 的相互作用非常靈活,它們(men) 能夠以多種不同的方式耐受病毒突變,最終實現相同的終點,所以你無法預測接下來會(hui) 發生什麽(me) 。”

 

  拉卡內(nei) 洛指出,科學家可能預測一些非常明顯的病毒突變,例如刺突蛋白上某些氨基酸變化會(hui) 影響抗體(ti) 結合,或者刺突受體(ti) 結合區域的變化會(hui) 影響病毒粘附和進入人體(ti) 細胞的入侵能力,盡管科學家無法預測哪些突變會(hui) 對病毒帶來優(you) 勢,但他們(men) 知道,病毒傳(chuan) 播得越多,就會(hui) 出現更多的突變。

 

  較強的選擇壓力,例如使用非常有效的疫苗,可能會(hui) 減少病毒複製和變異的機會(hui) ,與(yu) 此同時,非常微弱的選擇壓力意味著病毒不用必須選擇變異,因此任何變化僅(jin) 提供微不足道的優(you) 勢。

 

  當我們(men) 對病毒施加中等水平的選擇壓力時,麻煩就來了,例如:當你沒有強抗體(ti) 反應時,廣泛使用效果甚微的疫苗,或者延長第一劑和第二劑疫苗之間的時間,就可能成為(wei) “病毒新變種的滋生地”。摩爾說:“目前我們(men) 已意識到這一點。”

 

  因此,為(wei) 了防止未來病毒變種,我們(men) 需要確保按時對人們(men) 接種疫苗,阻止所謂的“逃逸突變”,我們(men) 需要阻止病毒擴散傳(chuan) 播,這將增大冠狀病毒產(chan) 生更多變異的概率。

 

  摩爾指出,由於(yu) 我們(men) 不能提前預測哪些特定的突變會(hui) 發生,要想比病毒突變落後兩(liang) 步,而不是20步,唯一的辦法是大幅加強對新變種病毒的監測,這樣科學家們(men) 就可以在病毒擴散之前,在實驗室裏發現並測試病毒新突變產(chan) 生的影響。


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