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細菌通常表現出很強的生物地理學特征—— 一些細菌在特定的位置很豐(feng) 富，而另一些卻沒有，這導致了將微生物用於(yu) 治療時的主要問題：細菌是如何進入錯誤位置的?當生物地理學出現“紊亂(luan) ”時，我們(men) 如何將正確的細菌添加到正確的位置?
然而，解決(jue) 這些問題有一個(ge) 很大的障礙，細菌是如此的微小和眾(zhong) 多，有著非常多樣化和複雜的種群，這給理解哪些細菌亞(ya) 群生活在哪裏以及什麽(me) 樣的基因或代謝能力讓它們(men) 在這些“錯誤”的地方茁壯成長帶來了重大挑戰。
近日，美國哈佛大學等機構的研究人員在發表於(yu) 《基因組生物學》上的一項新研究中，檢測了人類口腔微生物群，發現口腔某些區域的細菌亞(ya) 群存在令人印象深刻的變異。
“作為(wei) 微生物生態學家，我們(men) 著迷於(yu) 細菌是如何把任何棲息地分割成不同的小生境的。”論文作者之一、哈佛大學博士候選人Daniel R. Utter說。
測序和生物信息學方法的最新進展為(wei) 揭示細菌群落的複雜性提供了新的方法。Utter和Colleen Cavanaugh、Edward C. Jeffrey等人用這些最先進的測序和分析方法更好地了解了口腔微生物。
“口腔是研究微生物群落的完美地方。”芝加哥大學醫學係的助理教授 A. Murat Eren說，“它不僅(jin) 是胃腸道的開端，而且是一個(ge) 微生物種類足夠豐(feng) 富的非常特殊和小的環境，我們(men) 可以真正開始回答有關(guan) 微生物群係及其進化的有趣問題。”
該團隊搜索了公共數據庫，下載了100個(ge) 基因組，這些基因組代表了口腔中常見的四種細菌。借助新技術，研究人員發現了大量可變性。例如，在一種微生物中，不同的基因形式與(yu) 口腔內(nei) 的一個(ge) 不同部位有很強的相關(guan) 性。在許多情況下，該團隊能夠確定少數基因，這些基因可能解釋一個(ge) 特定細菌群體(ti) 的特定棲息地。通過應用元組學，研究人員還能夠確定人們(men) 口中的遊離細菌與(yu) 實驗室培養(yang) 的同類細菌的具體(ti) 區別。
專(zhuan) 家認為(wei) ，這項研究和其他類似的研究可以為(wei) 口腔微生物在人類健康中的作用提供了新見解。
相關(guan) 論文信息：https://doi.org/10.1186/s13059-020-02200-2
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