記者從(cong) 中國科學院昆明動物研究所獲悉,該所與(yu) 國內(nei) 多家研究機構合作,解析了新型冠狀病毒基因組的演化規律,提出了具有層次結構的譜係、亞(ya) 譜係劃分係統。《科學通報》期刊發表了這一重要成果。
隨著感染人數增加,新冠病毒會(hui) 快速發展出許多不同的株係。人類急需對這些新出現的變異進行梳理與(yu) 描述,並更加精細化地展示新冠病毒在人群中的演變軌跡。
中科院昆明動物研究所呂雪梅、張亞(ya) 平課題組與(yu) 北京大學生命科學學院陸劍課題組、中國疾病預防控製中心譚文傑課題組等團隊合作,分析了121618個(ge) 高質量病毒基因組中的單核苷酸變異,篩選出201個(ge) 代表性單核苷酸變異,進而逐級劃分出130個(ge) 亞(ya) 譜係,繪製成完整的反映各個(ge) 譜係之間親(qin) 緣關(guan) 係的單倍型網絡圖,同時建立了實時更新的配套網站以方便查看。
為(wei) 闡明不同亞(ya) 譜係病毒的流行程度是否有所不同,研究團隊依據譜係劃分係統對有具體(ti) 采樣時間信息的119168個(ge) 高質量病毒基因組進行劃分,分析結果顯示,在地理條件、交通運輸、文化風俗、防疫政策、超級傳(chuan) 播者等各種因素共同作用下,病毒譜係在不同地域間有各自獨特的分布模式。
研究團隊還收集了國內(nei) 從(cong) 2020年4月到2021年1月的輸入病例數據,將其在譜係劃分係統單倍型網絡上進行展示,可以為(wei) 輸入型病例的來源提供推斷信息。
此項研究囊括了目前出現的絕大多數新冠基因組變異,並整理了其譜係關(guan) 係,闡明各個(ge) 譜係時空分布的規律,搭建出新冠病毒演化的大體(ti) 框架,對理解病原體(ti) 變異規律、新冠流行病學追蹤、預測病毒的演化方向有重要意義(yi) 。
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