不結球白菜俗稱青菜、小白菜,栽培麵積由2005年的800萬(wan) 畝(mu) 上升到現在的2100萬(wan) 畝(mu) 左右,已成為(wei) 第三大蔬菜作物。
近日,南京農(nong) 業(ye) 大學園藝學院教授侯喜林團隊在《園藝研究》在線發表研究論文。該團隊經過十多年深入研究,揭示了不結球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營養(yang) 物質的代謝機製,為(wei) 優(you) 良性狀分子設計育種奠定了堅實基礎。
該研究以不結球白菜“蘇州青”為(wei) 材料,利用最新的測序手段,獲得了396.83Mb近完整的高質量染色體(ti) 級基因組,並對其功能進行注釋,其ContigN50為(wei) 2.83Mb。此基因組質量高於(yu) 現有其他白菜基因組。
根據這一新基因組,研究發現重複序列占全基因組的比例約為(wei) 53%,並且注釋得到了48,158個(ge) 蛋白質編碼基因。比較基因組分析證實,不結球白菜經曆了一個(ge) 與(yu) 其他十字花科物種共享的全基因組三倍化(WGT)事件,這發生在與(yu) 擬南芥共享的WGD事件之後,為(wei) 研究芸薹屬芸薹種亞(ya) 種之間分化提供重要的依據。對維生素C和硫代葡萄糖苷(GSLs)合成和代謝途徑相關(guan) 基因進行了鑒定和比較分析,得到了串聯複製導致的基因拷貝數變異,並且GSL基因在白菜基因組中發生了高度擴張。聯合轉錄組分析,對相關(guan) 基因的表達進行了探究,揭示了不結球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營養(yang) 物質的代謝調控機製
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