新技術可“預覽”DNA存儲數據文件
來源:科技日報
作者:張夢然
發布時間:2021-06-11
瀏覽次數:1161
新技術可“預覽”DNA存儲數據文件
在DNA數據存儲這一領域的研究一直強調其持久性和存儲海量信息的能力,但對DNA文件中數據“預覽”方麵的研究尚待突破。
圖片來源:視覺中國

  科技日報北京6月10日電 (記者張夢然)據英國《自然·通訊》雜誌10日發表的一項最新成果,美國北卡羅來納州立大學研究人員將DNA數據存儲(chu) 方麵的長期挑戰轉化為(wei) 一種實用工具——為(wei) 用戶提供存儲(chu) 數據文件的“預覽”,例如圖像文件的縮略圖版本。這使得整個(ge) DNA存儲(chu) 係統數據效率大為(wei) 提高,同時更具兼容性。

  全球的數據量不斷增加,傳(chuan) 統的存儲(chu) 架構,如硬盤和磁帶,越來越難以跟上數據存儲(chu) 的需要。隨著這些裝置逐漸達到存儲(chu) 極限,DNA被當作一種長期存儲(chu) 方案提出來,這是一項非常有吸引力的技術,因為(wei) 隻需要一個(ge) 小片段就可以存儲(chu) 大量數據,信息可以長時間保持,又非常節能。

  但是科學家們(men) 一直還無法實現對DNA文件中數據的“預覽”——如果你想知道文件是什麽(me) ,那你必須“打開”整個(ge) 文件。

  據研究人員介紹,為(wei) 了識別和提取指定文件,大多數係統使用聚合酶鏈反應(PCR)。具體(ti) 來說,使用與(yu) 相應引物結合序列匹配的小型DNA引物來識別包含所需文件的DNA鏈。然後係統使用PCR製作大量相關(guan) DNA鏈的副本,再對整個(ge) 樣本進行測序。該過程會(hui) 複製大量目標DNA鏈,但目標鏈的信號比樣本的其餘(yu) 部分更強,從(cong) 而可以識別目標DNA序列並讀取文件。然而,DNA數據存儲(chu) 研究人員麵臨(lin) 的一個(ge) 巨大挑戰就是,如果兩(liang) 個(ge) 或多個(ge) 文件具有相似的文件名,PCR將無意中複製多個(ge) 數據文件的片段。因此,用戶必須為(wei) 文件指定非常不同的名稱,以避免產(chan) 生數據混亂(luan) 。

  此次,北卡羅來納州立大學研究團隊開發的這種技術,利用相似的文件名可以打開整個(ge) 文件或該文件的特定子集。這是通過在命名文件和文件的給定子集時使用特定的命名約定來實現的,研究人員可以PCR過程的幾個(ge) 參數,溫度、樣本中DNA的濃度以及樣本中試劑的類型和濃度,來選擇是“打開”整個(ge) 文件還是隻“打開”其“預覽”版本。

  這一新技術的優(you) 勢體(ti) 現在效率和費用兩(liang) 大方麵,該論文的第一作者、研究人員凱爾·托梅克表示,“如果你不確定哪個(ge) 文件包含你想要的數據,也不必對所有潛在文件中的所有DNA進行測序,相反,還可以對DNA文件的更小部分進行測序以作為(wei) 預覽”。

  研究團隊成員表示,這一技術已展示了與(yu) 其他文件類型廣泛兼容的能力,目前他們(men) 正在尋找行業(ye) 合作夥(huo) 伴來幫助探索該技術的商業(ye) 可行性。


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