探索可用於(yu) 結直腸癌早期診斷的新型生物標誌物是目前的研究熱點。近年來，研究者們(men) 發現在循環遊離DNA（cfDNA）中可檢出細菌等微生物DNA。然而，結直腸癌患者的循環細菌DNA是否存在特異性改變，及其能否作為(wei) 結直腸癌早期診斷的新型生物標誌物仍有待探索。

　　近日，浙江大學醫學院附屬第二醫院大腸外科教授丁克峰團隊在腫瘤學期刊Cancer Letters發表研究論文。研究報道了結直腸癌患者與(yu) 健康人群之間循環細菌DNA的差異性改變，探索了循環細菌DNA作為(wei) 結直腸癌早期診斷新型生物標誌物的潛力。

　　這項研究是首個(ge) 嚐試表征結直腸癌患者血液cfDNA中細菌DNA特征的研究，其結果發現了結直腸癌和健康人之間cfDNA細菌DNA組成的顯著差異，揭示了循環細菌DNA作為(wei) 結直腸癌早期診斷新型生物標誌物的潛力，為(wei) 發掘結直腸癌及腺瘤的非侵入性診斷方式開啟了一扇新的大門。

　　在這項概念驗證性研究中，研究人員納入了病理確診的早期結直腸癌患者、病理確診的結直腸腺瘤患者和腸鏡篩查陰性的健康人，提取血漿cfDNA並進行25-30X深度的全基因組測序（WGS）。他們(men) 將測序數據過濾去除比對至人類基因組的測序讀段，並將剩餘(yu) 測序讀段比對至細菌基因組，並計算循環細菌DNA的相對豐(feng) 度。根據循環細菌DNA的相對豐(feng) 度，科研團隊鑒定得到了127個(ge) 在結直腸癌患者與(yu) 健康人之間顯著差異的循環細菌DNA。

　　以結直腸癌患者和年齡、性別匹配的健康人作為(wei) 發現集，基於(yu) 上述127個(ge) 差異細菌使用隨機森林遞歸特征消除法，研究人員構建獲得了由28個(ge) 循環細菌DNA組成的結直腸癌早期診斷模型。

　　研究發現，基於(yu) 這28個(ge) 循環細菌DNA的相對豐(feng) 度進行主成分分析，可以發現結直腸癌患者與(yu) 結直腸腺瘤患者有較大重疊，而與(yu) 健康人幾乎不存在重疊。

　　進一步分析發現，結直腸腺瘤患者的28個(ge) 循環細菌DNA相對豐(feng) 度介於(yu) 健康人和結直腸癌患者之間，並且大多數循環細菌DNA相對豐(feng) 度更接近結直腸癌患者。

　　該模型在發現集中區分結直腸癌患者與(yu) 健康人的ROC曲線下麵積（AUC）為(wei) 0.98；在驗證集中，該模型的表現更為(wei) 優(you) 異。在另一低深度測序的驗證集中，當測序深度降低至1X時該模型依然有較好的預測效果，區分結直腸腫瘤患者（結直腸癌患者+結直腸腺瘤患者）與(yu) 非結直腸腫瘤個(ge) 體(ti) （其他癌症患者+健康人）的AUC為(wei) 0.86, 區分結直腸癌患者與(yu) 非結直腸腫瘤個(ge) 體(ti) 的AUC為(wei) 0.97。

　　相關(guan) 論文信息：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0304383520306273

關(guan) 注【深圳科普】微信公眾(zhong) 號，在對話框：
回複【最新活動】，了解近期科普活動
回複【科普行】，了解最新深圳科普行活動
回複【研學營】，了解最新科普研學營
回複【科普課堂】，了解最新科普課堂
回複【科普書(shu) 籍】，了解最新科普書(shu) 籍
回複【團體(ti) 定製】，了解最新團體(ti) 定製活動
回複【科普基地】，了解深圳科普基地詳情
回複【觀鳥星空体育官网入口网站】，學習(xi) 觀鳥相關(guan) 科普星空体育官网入口网站
回複【博物學院】，了解更多博物學院活動詳情