生物科普:靠裂解酶這張“嘴” 噬菌體輕鬆“吃掉”超級細菌
來源:科技日報
發布時間:2020-04-04
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       在人或動物的腸道、口腔及生殖道內(nei) ,普遍存在著一種“共生菌”——糞腸球菌。近年來研究發現,由於(yu) 新型抗生素的研製速度遠遠趕不上耐藥菌的進化速度,部分糞腸球菌耐藥性嚴(yan) 重,逐漸演變成“超級細菌”。

        俗話說“一物降一物”,“超級細菌”的天敵又會(hui) 是誰呢?來自福建師範大學生命科學學院、南方生物醫學研究中心歐陽鬆應教授認為(wei) ,噬菌體(ti) 或能做到。日前,他們(men) 課題組在國際病原學雜誌《公共科學圖書(shu) 館-病原體(ti) 》上發表研究稱,一個(ge) 結構類似“八爪魚”的裂解酶“LysIME-EF1”,能夠高效裂解多種糞腸球菌臨(lin) 床株,具有巨大的潛在應用價(jia) 值。

        歐陽鬆應表示,“LysIME-EF1”可以作為(wei) 生物前體(ti) ,用來開發針對糞腸球菌臨(lin) 床株的生物藥物,最終解決(jue) 攻克耐藥細菌的難題,而噬菌體(ti) 療法有望成為(wei) 人類對抗細菌的最後一道防線。
 

        細菌越來越“聰明” 進化出一係列“逃生”策略

        糞腸球菌是一種革蘭(lan) 氏陽性菌,又名糞鏈球菌,可引起人的心內(nei) 膜炎、菌血症、泌尿道感染及腦膜炎等多種疾病。在需氧革蘭(lan) 氏陽性菌導致的醫院內(nei) 感染中,其致病率僅(jin) 次於(yu) 葡萄球菌。在全球範圍內(nei) 每年由於(yu) 糞腸球菌感染而導致死亡的人數高達1.7萬(wan) ,並且還在逐年攀升。

        近年來,由於(yu) 抗生素的長期和大量不規範使用,糞腸球菌獲得性耐藥性不斷上升,治療糞腸球菌感染日益困難。“細菌耐藥性又稱抗藥性,是指細菌暴露於(yu) 抗細菌藥物(如常用的抗生素)時發生改變,使得這些藥物逐漸失去效果,不能發揮抗菌作用。”歐陽鬆應說。

        據介紹,糞腸球菌長期對抗藥物,已經越來越“聰明”,進化出一係列“逃生”策略:能通過改變青黴素結合蛋白的結構,降低與(yu) 青黴素的親(qin) 和力使藥物失效,來“逃避”被殺死的命運;能編碼產(chan) 生青黴素酶來降解青黴素,實現對青黴素這類抗生素的耐藥性;它還能形成生物包被膜,將自己緊緊包裹在膜內(nei) ,從(cong) 而使藥物作用失敗。

        究其原因,歐陽鬆應分析,對抗糞腸球菌藥物大多數為(wei) 多年前所研發,更新換代速度慢;有些糞腸球菌在形態結構上產(chan) 生耐藥性變化,同時糞腸球菌耐藥機理研究不透徹,缺乏相應的實驗數據指導藥物開發。因此,目前急需解決(jue) 的問題是徹底了解糞腸球菌耐藥機理,為(wei) 藥物研發提供理論基礎。

        “隨著細菌耐藥性問題的日益突出,特別是農(nong) 業(ye) 農(nong) 村部規定2020年起飼料中全麵禁止添加抗生素,尋找新的抗菌製劑已刻不容緩。”歐陽鬆應表示,而噬菌體(ti) 及其裂解酶,因具備高效殺菌能力,被譽為(wei) 糞腸球菌的“天敵”。
 

        “撕碎”細菌細胞壁 噬菌體(ti) 及其裂解酶成抗菌“生力軍(jun) ”

        噬菌體(ti) 及其裂解酶為(wei) 什麽(me) 能抗菌?其抗菌機理與(yu) 現有藥物有什麽(me) 不同?

        歐陽鬆應告訴科技日報記者,噬菌體(ti) 是指能夠“吃”細菌的一些病毒,它在地球的每個(ge) 角落隨處可見,在泥土、動物內(nei) 髒、人類手上等,都可以找到噬菌體(ti) 的蹤影。“幸運的是,它對人體(ti) 無害,隻能專(zhuan) 門以細菌為(wei) 生。而且每種噬菌體(ti) 幾乎隻‘吃’一種細菌,因此它們(men) 能靶向特異的致病細菌。同時,它有自限性,一旦針對的細菌群被消滅,其數量將銳減,不會(hui) 在體(ti) 內(nei) 大量存活。”歐陽鬆應說。

        裂解酶即噬菌體(ti) 的“嘴巴”,它的作用在於(yu) 撕碎細菌的細胞壁,在與(yu) 細菌細胞壁接觸的數秒內(nei) ,就可以“撕碎”細菌細胞壁,並能高效裂解多種細菌。據歐陽鬆應介紹,由於(yu) 噬菌體(ti) 是病毒,它對細菌的攻擊是“物理攻擊”,產(chan) 生耐藥性的可能性遠小於(yu) 抗生素,因而不存在抗藥性問題,故可作為(wei) 一種潛在的抗菌藥物,而且製備效率高、費用低。

        早在上世紀70年代,就有科學家用噬菌體(ti) 療法,治好了500例因抗生素使用過度導致菌群失調的嬰幼兒(er) 。這些孩子們(men) 因患敗血症或肺炎, 接受2到3周抗生素治療後,導致體(ti) 內(nei) 發生菌群失調, 出現腹瀉、體(ti) 重減輕等現象。經噬菌體(ti) 及雙歧杆菌治療後, 從(cong) 腹瀉症狀減輕和體(ti) 重增加情況來看, 所有患兒(er) 的症狀都有明顯臨(lin) 床改善。

        當前,國內(nei) 關(guan) 於(yu) 噬菌體(ti) 裂解酶的研究起步較晚,大部分研究還處於(yu) 實驗室階段。本次研究中,歐陽鬆應團隊分離獲得噬菌體(ti) “IME-EF1”,並找到該噬菌體(ti) 的裂解酶基因,將該裂解酶命名為(wei) “LysIME-EF1”。研究發現,“LysIME-EF1”能夠裂解從(cong) 臨(lin) 床上分類的多種糞腸球菌。
 

        結構似“八爪魚” 具備捕殺糞腸球菌超能力

        相比其他病菌,糞腸球菌對環境適應力和抵抗力強,如在被裂解的過程中,容易形成生物包被膜,裂解酶從(cong) 外部需要突破包被膜,才能直接作用於(yu) 細菌。同時,該病菌細胞壁較厚,所需裂解時間稍長。麵對如此“狡猾”的對象,“LysIME-EF1”如何捕殺糞腸球菌?

        歐陽鬆應團隊在研究中發現,“LysIME-EF1”由一個(ge) 水解細菌細胞壁的功能域和一個(ge) 結合細菌細胞壁的功能域組成。結合功能域像一個(ge) 八爪魚的“吸盤”,由4個(ge) 分子組成,它能牢牢地吸住“獵物”糞腸球菌。而水解功能域呈現球狀,像八爪魚的“頭部”連在“吸盤”上,中間通過柔性“脖子”連接。當“吸盤”吸住獵物後,球狀“嘴巴”便通過柔性“脖子”吃掉獵物。

        “‘LysIME-EF1’能夠高效裂解,與(yu) 其結構的獨特性密不可分。”歐陽鬆應進一步解釋,與(yu) 其他裂解酶不一樣的獨特結構,提高了它與(yu) 細菌的結合能力,並且結構上的4個(ge) 分子和催化功能域都是由一個(ge) 基因編碼,而其他裂解酶結合功能域隻有一個(ge) 分子,這賦予“LysIME-EF1”高效裂解多種糞腸球菌臨(lin) 床株的超能力,催化活性和裂解範圍比其他的裂解酶高效和寬廣。

        歐陽鬆應團隊還通過流式細胞分篩技術及細菌裂解實驗,找到了裂解酶“LysIME-EF1”與(yu) 細胞壁結合的關(guan) 鍵位點,填補了相關(guan) 機製研究的空白。裂解酶與(yu) 細菌細胞壁的結合過程是裂解酶發揮裂解活性必不可少的一個(ge) 步驟,由於(yu) 細菌細胞壁成分複雜,一直以來,很難徹底了解裂解酶是如何結合到細菌細胞壁。他們(men) 通過分析裂解酶“LysIME-EF1”的結構,發現其底部“吸盤”結構帶有正電荷,推測可能與(yu) 細胞壁上某些帶負電荷的組分結合。他們(men) 進一步開展係列實驗,結果驗證了他們(men) 的推測並找到了關(guan) 鍵結合位點。

        “針對這些位點,我們(men) 可以開展相關(guan) 實驗,通過提高裂解酶與(yu) 細菌細胞壁的結合能力來提高裂解活性。”歐陽鬆應表示,他們(men) 打算根據這個(ge) 裂解酶的結構特征,采用計算機模擬的方法,確定能與(yu) 其結合的底物,從(cong) 而拓展它的應用。

        歐陽鬆應告訴記者,他們(men) 的研究首次從(cong) 結構和功能角度闡明了“LysIME-EF1”的作用機理,對開發針對糞腸球菌臨(lin) 床株的生物藥物具有重要意義(yi) 。目前,這種裂解酶對近30株臨(lin) 床上引起尿道感染、敗血症、化膿性腹部感染等的致病性糞腸球菌,都擁有很高的裂解活性。下一步,團隊將根據相關(guan) 結構信息,開展裂解酶“LysIME-EF1”的改造工作,擴寬裂解譜,同時建立相關(guan) 動物模型,加快臨(lin) 床研發的進程。

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